Följande alternativ är tillgängliga på startmenyn i Windows 9xMe:
* Normal - Detta är standardalternativet och startar Windows på vanligt sätt.
* Säkert läge - Det här alternativet startar Windows i ett begränsat tillstånd med minimala drivrutiner och tjänster laddade, vilket kan vara till hjälp vid felsökning av problem.
* Säkert läge med nätverk - Det här alternativet startar Windows i felsäkert läge men laddar också nätverksdrivrutiner och tjänster, vilket kan vara till hjälp för felsökning av nätverksproblem.
* Säkert läge med kommandotolk - Det här alternativet startar Windows i felsäkert läge men istället för det grafiska användargränssnittet visas en kommandotolk, vilket kan vara till hjälp för avancerad felsökning.
* MS-DOS-läge - Det här alternativet startar Windows i MS-DOS-läge, vilket är ett textbaserat operativsystem som var tillgängligt före Windows.
* Startmeny - Det här alternativet visar startmenyn igen, vilket låter dig välja ett annat alternativ.