I den traditionella System Development Life Cycle-metoden (SDLC) spelar systemanalytikern en mycket viktig och ofta central roll i analys- och designfasen. Som den som ansvarar för att översätta affärskrav till tekniska specifikationer är systemanalytikern involverad i både utrednings- och utvärderingsfasen av systemanalysprocessen. Under utredning arbetar systemanalytikern med att förstå affärsaktiviteter och processer för att få en uppfattning om omfattningen och målen för det tilltänkta datasystemet. Det är denna förståelse som ska omvandlas till mer tekniska krav under utvärderingen, där potentiella informationssystemlösningar beaktas.
I jämförelse kan systemanalytikern spela väldigt olika roller under prototypmetoden. En typisk roll är att ta på sig en mer underlättande kapacitet. Under denna roll arbetar systemanalytikern för att underlätta gränssnittet för andra projektutvecklingsteammedlemmar, såsom slutanvändare och IT-personal. Andra gånger kan systemanalytikern ta en mer aktiv roll i själva utvecklingen av prototypen, som att utveckla skärmlayouter eller testplaner för prototypsystemet.
I slutändan, om en systemanalytiker följer en mer underlättande roll eller en mer utvecklingsorienterad roll under prototypmetoden beror på vilken typ av prototypstrategi som används. För iterativ prototypframställning, där systemutvecklingsiterationer är inkrementella, kan en aktiv roll som omfattar både underlättande och utvecklingsaktiviteter krävas. För evolutionär prototyping, där prototypen utvecklas oberoende men successivt förfinas och förändras enligt feedback från slutanvändare, kommer systemanalytikern sannolikt att spela en mer underlättande roll.