FLAC-filstorlekar varierar beroende på ljudinnehållet, men vanligtvis är de större än MP3-filer. En genomsnittlig FLAC-filstorlek kan variera från 20 till 50 megabyte (MB) per minut ljud, medan en MP3-fil av samma längd kan vara runt 3 till 5 MB. Dessutom kan filstorleken för en FLAC-fil påverkas av samplingshastigheten, bitdjupet och antalet kanaler.
