PDB-filer lagrar data som hänför sig till de tredimensionella strukturerna av proteiner, nukleinsyror och deras komplex; de genereras med användning av röntgenkristallografi eller NMR-spektroskopi.
Mer specifikt är Protein Data Bank (PDB) ett förråd för experimentellt bestämda strukturer av proteiner, nukleinsyror och andra biologiska makromolekyler. PDB-filer lagrar atomkoordinaterna och andra relaterade data för dessa molekyler, vilket gör det möjligt för forskare att visualisera och analysera deras strukturer och att studera interaktionerna mellan olika molekyler. PDB-filer används i stor utsträckning inom strukturbiologi, läkemedelsdesign och andra forskningsområden.
