MP i MP3 kommer faktiskt från organisationen som standardiserade sin teknik, Moving Picture Experts Group (MPEG). Som namnet antyder, syftar MPEG till att skapa standarder för komprimering av rörliga bilder, ljud och relaterade teknologier.
"MP" i MP3 är en förkortning för MPEG-1 Audio Layer III. "Audio Layer III" hänvisar till det tredje lagret i MPEG-1-ljudkomprimeringsalgoritmen. Lagernummer 3 anger att detta är det tredje kodningsskiktet av ljuddata baserat på MPEG-standarden.