Det största chippet på ett moderkort är Central Processing Unit (CPU), även känd som mikroprocessorn eller processorn. CPU:n är ansvarig för att kontrollera alla andra komponenter på moderkortet och utföra instruktionerna för programvaran. Det är datorns hjärna och utför alla beräkningar och bearbetningar som krävs för att köra program. CPU:n är vanligtvis placerad i mitten av moderkortet och är ansluten till andra komponenter via stift eller ett uttag.