MicroATX ökar inte den totala kostnaden för ett system baserat på antalet expansionsplatser på moderkortet. MicroATX-moderkort har generellt färre expansionsplatser jämfört med ATX-moderkort, vilket kan leda till en lägre kostnad för själva moderkortet. Kostnadsskillnaden är dock vanligtvis försumbar och påverkar inte den totala systemkostnaden nämnvärt. Den totala kostnaden för ett system beror på olika faktorer, såsom de valda komponenterna (t.ex. CPU, GPU, minne, lagring), fodralstorlek, strömförsörjning och ytterligare funktioner eller tillbehör.
