Hastigheten på ett moderkort mäts vanligtvis i gigaöverföringar per sekund (GT/s). Detta mått refererar till den hastighet med vilken data överförs mellan moderkortet och andra komponenter, såsom processor, minne och lagringsenheter. Ju högre GT/s-betyg desto snabbare kan moderkortet bearbeta och överföra data, vilket leder till förbättrad systemprestanda.
Moderkortets hastighet påverkas av flera faktorer, inklusive den chipset som används, antalet och generationen av tillgängliga PCIe-banor och minnesgränssnittets frekvens. Chipset från olika tillverkare (t.ex. Intel, AMD) erbjuder olika prestandanivåer och stöder olika funktioner. Antalet PCIe-banor avgör hur många höghastighetsenheter (t.ex. grafikkort, expansionskort) som kan anslutas till moderkortet. Minnesgränssnittsfrekvensen indikerar hur snabbt data kan överföras mellan moderkortet och systemminnet (RAM).
Moderna moderkort stöder ofta DDR4 eller DDR5 minnesstandarder, med högre frekvenser (t.ex. DDR4-3200, DDR5-6000) vilket indikerar snabbare dataöverföringshastigheter. Dessutom kan funktioner som multi-GPU-stöd (t.ex. SLI, CrossFire), överklockningsmöjligheter och inbyggt nätverk (LAN) påverka moderkortets totala hastighet och funktionalitet.