Disketter har flera nackdelar som har lett till att de gradvis har minskat i användning:
Begränsad lagringskapacitet :Disketter har en mycket begränsad lagringskapacitet jämfört med dagens standarder. Det vanligaste diskettformatet, 3,5-tumsdisken, kan bara lagra upp till 1,44 megabyte (MB) data. Detta är mycket litet jämfört med moderna lagringsenheter som USB-minnen och hårddiskar.
Långsamma dataöverföringshastigheter :Disketter har långsam dataöverföringshastighet. Den vanliga 3,5-tumsdisketten kan läsa och skriva data med en maximal hastighet av 250 kilobyte per sekund (KBps). Detta är mycket långsamt jämfört med moderna lagringsenheter, som kan överföra data i megabyte eller till och med gigabyte per sekund.
Tillförlitlighetsproblem :Disketter kan vara opålitliga. De är mycket känsliga för damm, smuts och magnetiska fält, vilket kan orsaka fel vid läsning eller skrivning av data. Dessutom kan disketter lätt skadas om de tappas eller utsätts för överdriven värme eller kyla.
Brist på bakåtkompatibilitet :Disketter är inte bakåtkompatibla med moderna datorer. De flesta moderna datorer har inga disketter, så de kan inte läsa eller skriva data från disketter.
Inkurans :Disketter anses nu vara föråldrad lagringsteknik. De har ersatts av mer tillförlitliga, högre kapacitet och snabbare lagringsenheter.