Det är inte möjligt att koppla in ett PCI-e-kort i en PCI-kortplats. Kontakterna för de två standarderna är olika och det finns ingen adapter att konvertera mellan dem.
PCI-e-kortplatser och kort har fler stift och större kontakter än PCI-kortplatser och kort. PCI-e skiljer sig också elektriskt från PCI:PCI-enheter fungerar på 3,3 V medan PCI-e-enheter kan antingen arbeta på 3,3 V eller 12 V. De är inte elektriskt kompatibla och försök att använda den ena i den andra kan allvarligt skada hårdvaran.