bioperl är en populär open source-projekt som ger ett omfattande bibliotek av moduler för att hantera och manipulera data avseende biovetenskap . Forskarna bidrar till bioperl moduler som är skrivet i programmeringsspråket Perl . Många vetenskapsmän och ingenjörer använder MATLAB , en hög nivå programmeringsspråk utvecklat av Mathworks för tekniska beräkningar . MATLAB är populärt i både akademi och näringsliv eftersom dess språk tillåter användare att snabbt skapa kod för att analysera data , utveckla algoritmer och skapa visualiseringar . Hellre än att lära Perl , kan du dra nytta av bioperl funktioner genom att helt enkelt ringa bioperl moduler från MATLAB , alltså dra nytta av dina befintliga kunskaper om MATLAB utöver den makt bioperl modulerna . Instruktioner
1
Installera bioperl på ditt system genom att följa instruktionerna lämpliga för ditt operativsystem på bioperl webbplats ( Bioperl.org ) .
2
Type " perl ( " BioPerlModule ' ) " i MATLAB kommandot fönster där " BioPerlModule " ersättas med namnet på den bioperl modul som du vill köra .
3
att exekvera en bioperl modul som kräver inmatning argument , typ " perl ( ' BioPerlModule ' , ' arg1 ' , ' arg2 ' , ... ) " , där " BioPerlModule " ersättas med namnet på den bioperl modulen och " ' arg1 ' , ' arg2 ' , ... " ersätts med namnen på de variabler du vill använda som bioperl modul argument .
